Protein–RNA interactions for Protein: A6NMZ7

COL6A6, Collagen alpha-6(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 2,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A6A6NMZ7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL6A6A6NMZ7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL6A6A6NMZ7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL6A6A6NMZ7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL6A6A6NMZ7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL6A6A6NMZ7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL6A6A6NMZ7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL6A6A6NMZ7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL6A6A6NMZ7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL6A6A6NMZ7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL6A6A6NMZ7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL6A6A6NMZ7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL6A6A6NMZ7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL6A6A6NMZ7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL6A6A6NMZ7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL6A6A6NMZ7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL6A6A6NMZ7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL6A6A6NMZ7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL6A6A6NMZ7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL6A6A6NMZ7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL6A6A6NMZ7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL6A6A6NMZ7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL6A6A6NMZ7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL6A6A6NMZ7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL6A6A6NMZ7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL6A6A6NMZ7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL6A6A6NMZ7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL6A6A6NMZ7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL6A6A6NMZ7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COL6A6A6NMZ7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms