Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDR42E2A6NKP2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms