Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE6

RRN3P2, Putative RRN3-like protein RRN3P2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2A6NIE6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RRN3P2A6NIE6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRN3P2A6NIE6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRN3P2A6NIE6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRN3P2A6NIE6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRN3P2A6NIE6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRN3P2A6NIE6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRN3P2A6NIE6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRN3P2A6NIE6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRN3P2A6NIE6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRN3P2A6NIE6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRN3P2A6NIE6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRN3P2A6NIE6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRN3P2A6NIE6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRN3P2A6NIE6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RRN3P2A6NIE6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRN3P2A6NIE6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRN3P2A6NIE6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRN3P2A6NIE6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRN3P2A6NIE6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RRN3P2A6NIE6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRN3P2A6NIE6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRN3P2A6NIE6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRN3P2A6NIE6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRN3P2A6NIE6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRN3P2A6NIE6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRN3P2A6NIE6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRN3P2A6NIE6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRN3P2A6NIE6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRN3P2A6NIE6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRN3P2A6NIE6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRN3P2A6NIE6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRN3P2A6NIE6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRN3P2A6NIE6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRN3P2A6NIE6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRN3P2A6NIE6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRN3P2A6NIE6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRN3P2A6NIE6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRN3P2A6NIE6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRN3P2A6NIE6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRN3P2A6NIE6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RRN3P2A6NIE6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RRN3P2A6NIE6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRN3P2A6NIE6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRN3P2A6NIE6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRN3P2A6NIE6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRN3P2A6NIE6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRN3P2A6NIE6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms