Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NEMP2A6NFY4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEMP2A6NFY4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NEMP2A6NFY4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEMP2A6NFY4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEMP2A6NFY4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEMP2A6NFY4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEMP2A6NFY4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEMP2A6NFY4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEMP2A6NFY4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEMP2A6NFY4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEMP2A6NFY4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NEMP2A6NFY4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEMP2A6NFY4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEMP2A6NFY4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEMP2A6NFY4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEMP2A6NFY4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEMP2A6NFY4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEMP2A6NFY4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEMP2A6NFY4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEMP2A6NFY4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NEMP2A6NFY4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEMP2A6NFY4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEMP2A6NFY4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms