Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCAF2A6NFQ2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCAF2A6NFQ2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TCAF2A6NFQ2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCAF2A6NFQ2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCAF2A6NFQ2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCAF2A6NFQ2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCAF2A6NFQ2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCAF2A6NFQ2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TCAF2A6NFQ2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TCAF2A6NFQ2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCAF2A6NFQ2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCAF2A6NFQ2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TCAF2A6NFQ2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCAF2A6NFQ2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCAF2A6NFQ2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCAF2A6NFQ2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TCAF2A6NFQ2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCAF2A6NFQ2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCAF2A6NFQ2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCAF2A6NFQ2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCAF2A6NFQ2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCAF2A6NFQ2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TCAF2A6NFQ2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCAF2A6NFQ2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCAF2A6NFQ2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCAF2A6NFQ2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCAF2A6NFQ2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TCAF2A6NFQ2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCAF2A6NFQ2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCAF2A6NFQ2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCAF2A6NFQ2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCAF2A6NFQ2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCAF2A6NFQ2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCAF2A6NFQ2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCAF2A6NFQ2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCAF2A6NFQ2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCAF2A6NFQ2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCAF2A6NFQ2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCAF2A6NFQ2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCAF2A6NFQ2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCAF2A6NFQ2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCAF2A6NFQ2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCAF2A6NFQ2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCAF2A6NFQ2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCAF2A6NFQ2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCAF2A6NFQ2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCAF2A6NFQ2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms