Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB9BQ9NP90 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms