Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP78Q5JTW2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms