Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTN1Q12860 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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