Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

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Length 646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCAMP43121 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCAMP43121 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCAMP43121 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCAMP43121 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCAMP43121 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCAMP43121 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCAMP43121 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCAMP43121 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCAMP43121 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCAMP43121 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MCAMP43121 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCAMP43121 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MCAMP43121 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MCAMP43121 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCAMP43121 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCAMP43121 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCAMP43121 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCAMP43121 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCAMP43121 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCAMP43121 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCAMP43121 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCAMP43121 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCAMP43121 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCAMP43121 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCAMP43121 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCAMP43121 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCAMP43121 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCAMP43121 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCAMP43121 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCAMP43121 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCAMP43121 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCAMP43121 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCAMP43121 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCAMP43121 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCAMP43121 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCAMP43121 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCAMP43121 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCAMP43121 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCAMP43121 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCAMP43121 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCAMP43121 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCAMP43121 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCAMP43121 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCAMP43121 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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