Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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