Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms