Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLE1Q9NVX2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms