Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP26Q9NRE1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP26Q9NRE1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms