Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20AQ9NP66 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms