Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms