Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BORCS6Q96GS4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BORCS6Q96GS4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms