Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF2Q96CJ1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms