Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H2Q13888 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H2Q13888 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H2Q13888 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H2Q13888 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H2Q13888 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H2Q13888 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms