Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 TEN1-CDK3-201ENST00000567351 3897 ntTSL 217.35■□□□□ 0.378e-7■■■□□ 16.6
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PABPC4Q13310 LSM10-202ENST00000476041 1006 ntTSL 317.14■□□□□ 0.336e-7■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.331e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.328e-7■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.241e-12■■■□□ 16.6
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PABPC4Q13310 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.171e-12■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 PXN-204ENST00000424649 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.211e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.241e-8■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 PXN-222ENST00000637624 4132 ntTSL 213.02□□□□□ -0.331e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 ELOVL1-205ENST00000468865 797 ntTSL 312.39□□□□□ -0.438e-7■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 PXN-202ENST00000267257 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.541e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 PXN-206ENST00000458477 3807 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.541e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 ALDOA-215ENST00000565355 538 ntTSL 518.6■□□□□ 0.571e-323■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 ALDOA-217ENST00000566130 801 ntTSL 217.12■□□□□ 0.331e-323■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.142e-8■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.042e-8■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.082e-8■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.132e-8■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.172e-8■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 RANBP1-210ENST00000435265 1879 ntTSL 222.24■■□□□ 1.154e-31■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.374e-31■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 H3F3B-213ENST00000593254 894 ntTSL 515.98■□□□□ 0.151e-12■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.44■□□□□ 0.382e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.252e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 PPT1-212ENST00000641236 2481 nt16.07■□□□□ 0.162e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.112e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.28■□□□□ 0.042e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 PPT1-217ENST00000641691 2253 nt14.96□□□□□ -0.012e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.042e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 PPT1-210ENST00000530704 2340 ntTSL 1 (best)14.15□□□□□ -0.142e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 PPT1-219ENST00000642050 4010 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.332e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 PPT1-211ENST00000641083 2353 nt12.5□□□□□ -0.412e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 PPT1-209ENST00000530076 1872 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.62e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.583e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.453e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.443e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 SKIV2L-206ENST00000470453 455 ntTSL 317.27■□□□□ 0.362e-9■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 STXBP2-208ENST00000595800 1974 ntTSL 222.99■■□□□ 1.272e-7■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 STXBP2-214ENST00000599400 811 ntTSL 517.62■□□□□ 0.412e-7■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 STXBP2-219ENST00000600702 770 ntTSL 215.83■□□□□ 0.122e-7■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.771e-8■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 RPS27A-206ENST00000468810 597 ntTSL 311.34□□□□□ -0.591e-43■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.31e-12■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.11e-7■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 BNIP3L-207ENST00000523949 875 ntTSL 311.63□□□□□ -0.551e-7■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 XPO6-213ENST00000568065 942 ntTSL 522.46■■□□□ 1.191e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.251e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 XPO6-208ENST00000565698 4255 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.391e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 MACROD1-204ENST00000541041 230 ntTSL 315.07■□□□□ 02e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 MACROD1-202ENST00000538042 264 ntTSL 213.09□□□□□ -0.312e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 AC124798.1-201ENST00000568280 2883 ntBASIC11.3□□□□□ -0.64e-9■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.564e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.534e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.534e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.514e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 NOC4L-203ENST00000538784 862 ntTSL 224.01■■□□□ 1.434e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.344e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.334e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.134e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.054e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 AL132780.3-201ENST00000555074 835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.414e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 TRIM44-201ENST00000299413 12964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.662e-10■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 HAUS4-213ENST00000554446 1129 ntTSL 510.85□□□□□ -0.674e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.342e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 STAR-202ENST00000520114 3448 ntTSL 211.14□□□□□ -0.632e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 RPS9-210ENST00000460761 644 ntTSL 217.41■□□□□ 0.385e-21■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 LMBR1L-207ENST00000547698 905 ntTSL 519.24■□□□□ 0.671e-7■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.671e-7■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 LMBR1L-202ENST00000417750 2334 ntTSL 217.54■□□□□ 0.41e-7■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 LMBR1L-208ENST00000547813 1024 ntTSL 516.8■□□□□ 0.281e-7■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 LMBR1L-216ENST00000550867 2800 ntTSL 1 (best)15.54■□□□□ 0.081e-7■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.071e-7■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 LMBR1L-227ENST00000552577 2083 ntTSL 213.02□□□□□ -0.331e-7■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 LMBR1L-229ENST00000553040 768 ntTSL 512.94□□□□□ -0.341e-7■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 YWHAB-206ENST00000479421 1097 ntTSL 513.31□□□□□ -0.281e-11■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.83e-7■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 HYPK-204ENST00000497142 428 ntTSL 215.3■□□□□ 0.043e-7■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 HYPK-203ENST00000458412 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.113e-7■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.163e-7■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.382e-9■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 SLC38A5-209ENST00000497336 493 ntTSL 516.99■□□□□ 0.312e-9■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.232e-9■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.232e-9■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.082e-9■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 RPLP2-202ENST00000524867 598 ntTSL 230.5■■■□□ 2.471e-323■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.466e-9■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 RPL18-201ENST00000084795 612 ntTSL 1 (best)21■□□□□ 0.951e-46■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.649e-7■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.119e-7■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 REXO1-207ENST00000590936 1271 ntTSL 518.3■□□□□ 0.524e-21■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 PPP2R5D-209ENST00000486843 462 ntTSL 38.88□□□□□ -0.994e-21■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 PUM1-201ENST00000257075 5360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.467e-8■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.897e-8■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.987e-8■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 CDK16-208ENST00000517426 1574 ntTSL 523.01■■□□□ 1.271e-6■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.123e-6■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 UXT-203ENST00000376964 894 ntTSL 218.35■□□□□ 0.532e-9■■■□□ 16.5
PABPC4Q13310 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.499e-11■■■□□ 16.5
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