Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA4Q13156 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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