Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR1DQ9Y2S0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR1DQ9Y2S0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms