Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
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