Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OPN5Q6U736 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms