Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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CACHD1Q5VU97 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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CACHD1Q5VU97 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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CACHD1Q5VU97 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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CACHD1Q5VU97 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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CACHD1Q5VU97 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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CACHD1Q5VU97 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CACHD1Q5VU97 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CACHD1Q5VU97 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CACHD1Q5VU97 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CACHD1Q5VU97 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CACHD1Q5VU97 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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CACHD1Q5VU97 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACHD1Q5VU97 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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