Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB2Q08289 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms