Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms