Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LOXL3P58215 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LOXL3P58215 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LOXL3P58215 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LOXL3P58215 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LOXL3P58215 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LOXL3P58215 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LOXL3P58215 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LOXL3P58215 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LOXL3P58215 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LOXL3P58215 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LOXL3P58215 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms