Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms