Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms