Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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FOXQ1Q9C009 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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FOXQ1Q9C009 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXQ1Q9C009 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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FOXQ1Q9C009 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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FOXQ1Q9C009 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXQ1Q9C009 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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