Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms