Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms