Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNGA3Q16281 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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