Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 ATG16L2-208ENST00000537143 519 ntTSL 221.15■□□□□ 0.982e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.752e-6■■■■□ 26
PCBP2Q15366 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.712e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 CTPS1-206ENST00000470271 801 ntTSL 318.79■□□□□ 0.62e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.592e-6■■■■□ 26
PCBP2Q15366 TSC22D4-205ENST00000493217 2060 ntTSL 1 (best)18.65■□□□□ 0.582e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.437e-14■■■■□ 26
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PCBP2Q15366 ATG16L2-214ENST00000540567 1492 ntTSL 1 (best)17.5■□□□□ 0.392e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.392e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 USF2-213ENST00000600341 1392 ntTSL 217.17■□□□□ 0.342e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 LRRFIP1-215ENST00000498053 593 ntTSL 316.89■□□□□ 0.292e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.292e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 PLEKHH3-207ENST00000591490 4339 ntTSL 216.67■□□□□ 0.262e-6■■■■□ 26
PCBP2Q15366 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.232e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 IKBKB-206ENST00000517890 2501 ntTSL 216.32■□□□□ 0.22e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 IKBKB-205ENST00000517812 523 ntTSL 315.84■□□□□ 0.132e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.072e-7■■■■□ 26
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PCBP2Q15366 IKBKB-209ENST00000518679 2784 ntTSL 214.41□□□□□ -0.12e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 USF2-206ENST00000594264 2742 ntTSL 214.28□□□□□ -0.122e-7■■■■□ 26
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PCBP2Q15366 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.152e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.152e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.162e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 IKBKB-207ENST00000517917 1731 ntTSL 214.02□□□□□ -0.162e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.182e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.212e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.222e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 ATG16L2-203ENST00000439504 3841 ntTSL 1 (best)13.61□□□□□ -0.232e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 ZNF611-216ENST00000601447 495 ntTSL 313.48□□□□□ -0.252e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 ERBB3-209ENST00000549282 561 ntTSL 413.32□□□□□ -0.282e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 ERBB3-207ENST00000549061 560 ntTSL 413.23□□□□□ -0.292e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 ATG16L2-211ENST00000538842 385 ntTSL 313.2□□□□□ -0.32e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 CABLES1-210ENST00000585061 584 ntTSL 513.2□□□□□ -0.32e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 IKBKB-211ENST00000519733 527 ntTSL 413.09□□□□□ -0.312e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.322e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 IKBKB-203ENST00000517388 577 ntTSL 412.91□□□□□ -0.342e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 PLEKHB2-210ENST00000487980 600 ntTSL 412.72□□□□□ -0.372e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 PLEKHB2-209ENST00000482225 644 ntTSL 212.72□□□□□ -0.372e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.392e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 CTPS1-202ENST00000372621 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.392e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.432e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.432e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 IKBKB-227ENST00000523105 1966 ntTSL 212.35□□□□□ -0.432e-7■■■■□ 26
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PCBP2Q15366 IKBKB-214ENST00000520201 5002 ntTSL 212.21□□□□□ -0.452e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.492e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.52e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 CACNB4-226ENST00000636496 430 ntTSL 511.91□□□□□ -0.52e-7■■■■□ 26
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PCBP2Q15366 IKBKB-215ENST00000520320 628 ntTSL 511.14□□□□□ -0.632e-7■■■■□ 26
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PCBP2Q15366 CABLES1-205ENST00000579963 2074 ntTSL 210.75□□□□□ -0.692e-7■■■■□ 26
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PCBP2Q15366 CACNB4-206ENST00000439467 2159 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.742e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 IKBKB-202ENST00000416505 4036 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.782e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 CACNB4-213ENST00000635743 745 ntTSL 510.06□□□□□ -0.82e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 CACNB4-202ENST00000360283 1885 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.822e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 AL133355.1-201ENST00000568017 2388 ntBASIC9.9□□□□□ -0.822e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 KANK1-210ENST00000619269 5688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.842e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 CACNB4-250ENST00000637418 2015 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.862e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 ZNF611-207ENST00000596702 538 ntTSL 4 BASIC9.67□□□□□ -0.862e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 KANK1-209ENST00000489369 7193 ntTSL 59.46□□□□□ -0.92e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 CACNB4-231ENST00000636721 1542 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.912e-7■■■■□ 26
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PCBP2Q15366 TMEM45B-202ENST00000524567 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.912e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 KANK1-206ENST00000382303 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.912e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 ZNF611-209ENST00000597343 860 ntTSL 59.32□□□□□ -0.922e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 CACNB4-261ENST00000637765 2955 ntTSL 59.26□□□□□ -0.932e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 DDX39B-217ENST00000474961 974 ntTSL 29.21□□□□□ -0.942e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 AC068547.1-203ENST00000637559 1373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.972e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 CABLES1-203ENST00000420687 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.982e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 ZNF611-210ENST00000597566 509 ntTSL 48.84□□□□□ -0.992e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 CACNB4-242ENST00000637216 1292 ntTSL 58.8□□□□□ -12e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 ZNF611-206ENST00000595798 2395 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.012e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 ZNF611-219ENST00000602162 3299 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.032e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 KANK1-205ENST00000382297 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.032e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 ENTPD1-AS1-211ENST00000454638 2933 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.042e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 CACNB4-264ENST00000637828 1831 ntTSL 58.55□□□□□ -1.042e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 DDX39B-216ENST00000462421 618 ntTSL 38.41□□□□□ -1.062e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 CABLES1-202ENST00000400473 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.082e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 ZNF611-203ENST00000540744 4417 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.27□□□□□ -1.092e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 CACNB4-230ENST00000636664 1698 ntTSL 58.21□□□□□ -1.12e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 CACNB4-248ENST00000637319 3549 ntTSL 58.12□□□□□ -1.112e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 KANK1-201ENST00000354485 6912 ntTSL 28.08□□□□□ -1.122e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 CACNB4-255ENST00000637530 3104 ntTSL 58.06□□□□□ -1.122e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 CACNB4-232ENST00000636762 3191 ntTSL 58.02□□□□□ -1.132e-7■■■■□ 26
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