Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDH1P12830 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDH1P12830 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDH1P12830 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDH1P12830 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDH1P12830 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDH1P12830 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDH1P12830 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDH1P12830 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDH1P12830 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDH1P12830 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH1P12830 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH1P12830 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH1P12830 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH1P12830 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH1P12830 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH1P12830 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDH1P12830 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms