Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms