Protein–RNA interactions for Protein: O43324

EEF1E1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1O43324 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEF1E1O43324 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EEF1E1O43324 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms