Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms