Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms