Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PALD1Q9ULE6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PALD1Q9ULE6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms