Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 CMSS1-202ENST00000463526 397 ntTSL 316.23■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 166.5
UTP3Q9NQZ2 CMSS1-201ENST00000421999 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.631e-7■■■■■ 166.5
UTP3Q9NQZ2 CMSS1-206ENST00000491299 881 ntTSL 59.08□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 166.5
UTP3Q9NQZ2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.436e-7■■■■■ 166.4
UTP3Q9NQZ2 SIK3-203ENST00000415541 3816 ntTSL 1 (best)8.65□□□□□ -1.026e-7■■■■■ 166.4
UTP3Q9NQZ2 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.086e-8■■■■■ 166.3
UTP3Q9NQZ2 TET3-202ENST00000409262 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.626e-7■■■■■ 166.3
UTP3Q9NQZ2 TMEM241-211ENST00000578520 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 324.38■■□□□ 1.492e-6■■■■■ 166.3
UTP3Q9NQZ2 TMEM241-206ENST00000482411 667 ntTSL 521.76■■□□□ 1.072e-6■■■■■ 166.3
UTP3Q9NQZ2 CDK6-204ENST00000473078 386 ntTSL 23.2□□□□□ -1.93e-9■■■■■ 166.1
UTP3Q9NQZ2 BSG-212ENST00000590218 545 ntTSL 220.77■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 166.1
UTP3Q9NQZ2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.594e-8■■■■■ 166.1
UTP3Q9NQZ2 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.134e-8■■■■■ 166.1
UTP3Q9NQZ2 ASPH-205ENST00000445642 3717 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.134e-8■■■■■ 166.1
UTP3Q9NQZ2 ASPH-201ENST00000356457 3730 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.314e-8■■■■■ 166.1
UTP3Q9NQZ2 AC074143.1-201ENST00000580114 1287 ntAPPRIS P5 TSL 527.33■■□□□ 1.972e-11■■■■■ 166.1
UTP3Q9NQZ2 HSF4-223ENST00000523077 828 ntTSL 219.5■□□□□ 0.712e-11■■■■■ 166.1
UTP3Q9NQZ2 AC074143.1-202ENST00000518753 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.44■□□□□ 0.222e-11■■■■■ 166.1
UTP3Q9NQZ2 MSH3-201ENST00000265081 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.514e-7■■■■■ 166.1
UTP3Q9NQZ2 GAS8-204ENST00000540721 1308 ntTSL 220.63■□□□□ 0.893e-7■■■■■ 166
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC9-215ENST00000524162 591 ntTSL 422.11■■□□□ 1.139e-7■■■■■ 166
UTP3Q9NQZ2 UNK-203ENST00000587258 660 ntTSL 515.01□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 165.9
UTP3Q9NQZ2 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 165.9
UTP3Q9NQZ2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.364e-7■■■■■ 165.8
UTP3Q9NQZ2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.14e-7■■■■■ 165.8
UTP3Q9NQZ2 CMIP-211ENST00000621537 4000 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.56e-7■■■■■ 165.7
UTP3Q9NQZ2 DSCR3-206ENST00000475009 715 ntTSL 217.26■□□□□ 0.353e-11■■■■■ 165.7
UTP3Q9NQZ2 DSCR3-209ENST00000488368 1013 ntTSL 1 (best)16.5■□□□□ 0.233e-11■■■■■ 165.7
UTP3Q9NQZ2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.233e-11■■■■■ 165.7
UTP3Q9NQZ2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.183e-11■■■■■ 165.7
UTP3Q9NQZ2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.113e-11■■■■■ 165.7
UTP3Q9NQZ2 DSCR3-203ENST00000399000 4398 ntTSL 1 (best)15.24■□□□□ 0.033e-11■■■■■ 165.7
UTP3Q9NQZ2 DSCR3-201ENST00000309117 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.233e-11■■■■■ 165.7
UTP3Q9NQZ2 DSCR3-208ENST00000480452 526 ntTSL 25.85□□□□□ -1.473e-11■■■■■ 165.7
UTP3Q9NQZ2 DSCR3-210ENST00000492514 318 ntTSL 34.67□□□□□ -1.663e-11■■■■■ 165.7
UTP3Q9NQZ2 B4GALNT4-203ENST00000526584 421 ntTSL 317.82■□□□□ 0.442e-11■■■■■ 165.6
UTP3Q9NQZ2 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 165.6
UTP3Q9NQZ2 NBAS-208ENST00000442506 4391 ntTSL 1 (best)12.36□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 165.6
UTP3Q9NQZ2 RALGDS-211ENST00000482648 5596 ntTSL 217.04■□□□□ 0.326e-7■■■■■ 165.6
UTP3Q9NQZ2 RALGDS-208ENST00000469972 5817 ntTSL 1 (best)16.76■□□□□ 0.276e-7■■■■■ 165.6
UTP3Q9NQZ2 NRBP2-204ENST00000529747 3693 ntTSL 218.55■□□□□ 0.563e-10■■■■■ 165.6
UTP3Q9NQZ2 PFKP-207ENST00000421751 658 ntTSL 416.76■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 165.5
UTP3Q9NQZ2 PFKP-204ENST00000407806 705 ntTSL 515.01□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 165.5
UTP3Q9NQZ2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.944e-7■■■■■ 165.5
UTP3Q9NQZ2 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.097e-7■■■■■ 165.5
UTP3Q9NQZ2 TNPO1-212ENST00000520850 863 ntTSL 217.27■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 165.3
UTP3Q9NQZ2 TNPO1-213ENST00000523768 2632 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.472e-7■■■■■ 165.3
UTP3Q9NQZ2 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 165.3
UTP3Q9NQZ2 MAN1B1-201ENST00000371587 1485 ntTSL 1 (best)12.75□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 165.3
UTP3Q9NQZ2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.675e-11■■■■■ 165.3
UTP3Q9NQZ2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.095e-11■■■■■ 165.3
UTP3Q9NQZ2 MTCL1-212ENST00000522146 580 ntTSL 46.52□□□□□ -1.374e-7■■■■■ 165.1
UTP3Q9NQZ2 POLR3H-207ENST00000432789 1598 ntTSL 227.3■■□□□ 1.963e-9■■■■■ 165.1
UTP3Q9NQZ2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.923e-9■■■■■ 165.1
UTP3Q9NQZ2 POLR3H-206ENST00000431534 1464 ntTSL 522.22■■□□□ 1.153e-9■■■■■ 165.1
UTP3Q9NQZ2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.53e-9■■■■■ 165.1
UTP3Q9NQZ2 POLR3H-203ENST00000396504 4176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.233e-9■■■■■ 165.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF148-208ENST00000495019 763 ntTSL 519.49■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 165.1
UTP3Q9NQZ2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 165.1
UTP3Q9NQZ2 MRPL55-226ENST00000473066 820 ntTSL 316.59■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 165.1
UTP3Q9NQZ2 MRPL55-231ENST00000492170 241 ntTSL 516.19■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 165.1
UTP3Q9NQZ2 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 165.1
UTP3Q9NQZ2 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 165.1
UTP3Q9NQZ2 MRPL55-232ENST00000495434 224 ntTSL 514.85□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 165.1
UTP3Q9NQZ2 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 165.1
UTP3Q9NQZ2 MRPL55-224ENST00000464148 636 ntTSL 514.07□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 165.1
UTP3Q9NQZ2 MRPL55-233ENST00000495899 790 ntTSL 213.13□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 165.1
UTP3Q9NQZ2 MRPL55-229ENST00000483159 790 ntTSL 513.13□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 165.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF148-202ENST00000465763 566 ntTSL 48.91□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 165.1
UTP3Q9NQZ2 PCMTD1-203ENST00000519559 1204 ntTSL 28.15□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 165.1
UTP3Q9NQZ2 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.57e-8■■■■■ 165
UTP3Q9NQZ2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.388e-7■■■■■ 164.9
UTP3Q9NQZ2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.528e-7■■■■■ 164.9
UTP3Q9NQZ2 SUPT5H-216ENST00000599335 3796 ntTSL 213.11□□□□□ -0.318e-8■■■■■ 164.9
UTP3Q9NQZ2 NRBP2-208ENST00000532940 1782 ntTSL 1 (best)26.02■■□□□ 1.762e-10■■■■■ 164.8
UTP3Q9NQZ2 NRBP2-210ENST00000533846 1623 ntTSL 1 (best)25.3■■□□□ 1.642e-10■■■■■ 164.8
UTP3Q9NQZ2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.692e-10■■■■■ 164.8
UTP3Q9NQZ2 NRBP2-209ENST00000533093 3877 ntTSL 1 (best)18.97■□□□□ 0.632e-10■■■■■ 164.8
UTP3Q9NQZ2 MINK1-207ENST00000572330 5299 ntTSL 518.43■□□□□ 0.542e-7■■■■■ 164.8
UTP3Q9NQZ2 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 164.8
UTP3Q9NQZ2 KIAA0355-206ENST00000589583 582 ntTSL 315.48■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 164.8
UTP3Q9NQZ2 KIAA0355-204ENST00000588470 632 ntTSL 515.45■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 164.8
UTP3Q9NQZ2 FNDC3B-207ENST00000469491 2916 ntTSL 218.66■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 164.8
UTP3Q9NQZ2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.33e-8■■■■■ 164.8
UTP3Q9NQZ2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.261e-6■■■■■ 164.8
UTP3Q9NQZ2 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.075e-7■■■■■ 164.8
UTP3Q9NQZ2 ANO9-208ENST00000534161 2158 ntTSL 218.31■□□□□ 0.522e-10■■■■■ 164.8
UTP3Q9NQZ2 ANO9-205ENST00000526142 2868 ntTSL 217.5■□□□□ 0.392e-10■■■■■ 164.8
UTP3Q9NQZ2 PFKFB3-218ENST00000639949 587 ntTSL 49.69□□□□□ -0.864e-7■■■■■ 164.7
UTP3Q9NQZ2 TBC1D7-208ENST00000421203 1544 ntTSL 220.55■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 164.7
UTP3Q9NQZ2 UBN1-209ENST00000592120 2305 ntTSL 222.19■■□□□ 1.141e-12■■■■■ 164.6
UTP3Q9NQZ2 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 164.6
UTP3Q9NQZ2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.118e-7■■■■■ 164.5
UTP3Q9NQZ2 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.988e-7■■■■■ 164.5
UTP3Q9NQZ2 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.478e-7■■■■■ 164.5
UTP3Q9NQZ2 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.498e-7■■■■■ 164.5
UTP3Q9NQZ2 MTA1-214ENST00000494026 852 ntTSL 518.91■□□□□ 0.626e-8■■■■■ 164.4
UTP3Q9NQZ2 MTA1-216ENST00000498644 871 ntTSL 217.77■□□□□ 0.446e-8■■■■■ 164.4
UTP3Q9NQZ2 AMOTL1-203ENST00000433060 8970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.523e-7■■■■■ 164.4
UTP3Q9NQZ2 AMOTL1-202ENST00000317829 8844 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.653e-7■■■■■ 164.4
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