Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 SLC2A8-205ENST00000419917 793 ntTSL 319.88■□□□□ 0.774e-8■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 SLC2A8-206ENST00000423934 933 ntTSL 519.83■□□□□ 0.774e-8■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 SLC2A8-208ENST00000439597 854 ntTSL 319.83■□□□□ 0.774e-8■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.494e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.362e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.272e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 SLC2A8-214ENST00000489239 859 ntTSL 315.98■□□□□ 0.154e-8■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 SLC2A8-212ENST00000484617 478 ntTSL 315.11■□□□□ 0.014e-8■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 PACS2-207ENST00000548265 402 ntTSL 215□□□□□ -0.012e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.083e-7■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 LAMA5-203ENST00000370691 3160 ntTSL 1 (best)12.95□□□□□ -0.346e-8■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 MROH1-204ENST00000527071 680 ntTSL 312.06□□□□□ -0.484e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 POLA1-203ENST00000480125 580 ntTSL 34.64□□□□□ -1.674e-8■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.412e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 QRICH2-203ENST00000524722 2253 ntTSL 1 (best)12.92□□□□□ -0.341e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 QRICH2-201ENST00000262765 5357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.521e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 SMOC1-202ENST00000381280 3666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.542e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 COL9A3-204ENST00000463487 760 ntTSL 518.93■□□□□ 0.626e-8■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.533e-7■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 DLGAP4-208ENST00000478910 2674 ntTSL 214.02□□□□□ -0.165e-10■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 DLGAP4-210ENST00000479951 631 ntTSL 312.23□□□□□ -0.455e-10■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 DLGAP4-209ENST00000479220 577 ntTSL 312.16□□□□□ -0.465e-10■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 DLGAP4-213ENST00000489701 2396 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.65e-10■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.218e-9■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 UQCC1-213ENST00000453855 1035 ntTSL 413.69□□□□□ -0.228e-9■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 UQCC1-214ENST00000457259 1987 ntTSL 1 (best)12.12□□□□□ -0.478e-9■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 UQCC1-210ENST00000424405 758 ntTSL 512.08□□□□□ -0.488e-9■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 UQCC1-206ENST00000374394 2329 ntTSL 212.02□□□□□ -0.498e-9■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 UQCC1-203ENST00000374380 2133 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.548e-9■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 UQCC1-209ENST00000397556 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.548e-9■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 UQCC1-201ENST00000349714 2188 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.568e-9■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 UQCC1-202ENST00000359226 2036 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.668e-9■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 UQCC1-212ENST00000443429 692 ntTSL 510.5□□□□□ -0.738e-9■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 UQCC1-205ENST00000374385 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.758e-9■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 UQCC1-211ENST00000438533 736 ntTSL 38.16□□□□□ -1.18e-9■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 UQCC1-222ENST00000497717 471 ntTSL 57.27□□□□□ -1.258e-9■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -01e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 POLR3E-214ENST00000565358 565 ntTSL 418.39■□□□□ 0.536e-7■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 POLR3E-205ENST00000563024 473 ntTSL 418.39■□□□□ 0.536e-7■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.137e-12■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.217e-8■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.365e-7■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.412e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.232e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.142e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 EML6-207ENST00000491655 471 ntTSL 418.6■□□□□ 0.574e-9■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.253e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.142e-7■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 FLOT1-208ENST00000470643 852 ntTSL 319.79■□□□□ 0.762e-7■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 FLOT1-210ENST00000484168 1101 ntTSL 519.79■□□□□ 0.762e-7■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 FLOT1-211ENST00000484693 1001 ntTSL 217.62■□□□□ 0.412e-7■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 FLOT1-207ENST00000454845 629 ntTSL 313.56□□□□□ -0.242e-7■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 FLOT1-205ENST00000438162 888 ntTSL 512.85□□□□□ -0.352e-7■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 WDR4-206ENST00000479429 759 ntTSL 521.03■□□□□ 0.962e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.822e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 WDR4-207ENST00000492742 2205 ntTSL 219.76■□□□□ 0.752e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.22e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 WDR4-205ENST00000476326 1977 ntTSL 1 (best)14.64□□□□□ -0.072e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 PTPRG-203ENST00000474889 9021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.761e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 ACAP3-212ENST00000492936 5319 ntTSL 1 (best)17.03■□□□□ 0.321e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.563e-6■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 GSTM4-202ENST00000336075 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.68e-7■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 GSTM4-213ENST00000638994 657 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.68e-7■■■■□ 26.1
PCBP2Q15366 NLGN2-203ENST00000572893 305 ntTSL 323.69■■□□□ 1.383e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 INPPL1-211ENST00000541544 530 ntTSL 221.39■■□□□ 1.012e-8■■■■□ 26
PCBP2Q15366 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.415e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 CNOT4-211ENST00000498534 481 ntTSL 211.01□□□□□ -0.656e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 CNOT4-208ENST00000465721 556 ntTSL 410.8□□□□□ -0.686e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.128e-8■■■■□ 26
PCBP2Q15366 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.048e-8■■■■□ 26
PCBP2Q15366 SHTN1-207ENST00000615301 6730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.858e-8■■■■□ 26
PCBP2Q15366 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.348e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 ZDHHC14-205ENST00000422910 2883 ntTSL 213.08□□□□□ -0.323e-6■■■■□ 26
PCBP2Q15366 ZDHHC14-209ENST00000523706 5146 ntTSL 213.07□□□□□ -0.323e-6■■■■□ 26
PCBP2Q15366 ZDHHC14-206ENST00000517432 3646 ntTSL 210.19□□□□□ -0.783e-6■■■■□ 26
PCBP2Q15366 SOX5-209ENST00000536911 855 ntTSL 38.93□□□□□ -0.988e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 SOX5-206ENST00000535530 576 ntTSL 48.47□□□□□ -1.058e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 SOX5-207ENST00000536629 570 ntTSL 48.08□□□□□ -1.128e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.773e-6■■■■□ 26
PCBP2Q15366 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.973e-6■■■■□ 26
PCBP2Q15366 VARS2-209ENST00000477288 6054 ntTSL 218.22■□□□□ 0.511e-6■■■■□ 26
PCBP2Q15366 R3HDM1-215ENST00000483021 539 ntTSL 317.99■□□□□ 0.472e-10■■■■□ 26
PCBP2Q15366 R3HDM1-213ENST00000463230 2241 ntTSL 212.39□□□□□ -0.432e-10■■■■□ 26
PCBP2Q15366 R3HDM1-208ENST00000438014 582 ntTSL 57.92□□□□□ -1.142e-10■■■■□ 26
PCBP2Q15366 R3HDM1-219ENST00000488035 502 ntTSL 33.91□□□□□ -1.782e-10■■■■□ 26
PCBP2Q15366 R3HDM1-207ENST00000436436 601 ntTSL 43.24□□□□□ -1.892e-10■■■■□ 26
PCBP2Q15366 DERL1-202ENST00000405944 1994 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.384e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 DERL1-201ENST00000259512 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.654e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 DERL1-206ENST00000524119 5513 ntTSL 410.15□□□□□ -0.784e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.362e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 FAM214A-206ENST00000561543 931 ntTSL 323.29■■□□□ 1.322e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.242e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 LRRFIP1-205ENST00000420665 570 ntTSL 322.76■■□□□ 1.232e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 PLEKHH3-205ENST00000591196 2640 ntTSL 1 (best)21.87■■□□□ 1.092e-6■■■■□ 26
PCBP2Q15366 ATG16L2-202ENST00000435507 2254 ntTSL 221.54■■□□□ 1.042e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 USF2-216ENST00000607959 1920 ntTSL 521.39■■□□□ 1.022e-7■■■■□ 26
PCBP2Q15366 ATG16L2-208ENST00000537143 519 ntTSL 221.15■□□□□ 0.982e-7■■■■□ 26
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