Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
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