Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms