Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIS18AQ9NYP9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
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