Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC3GQ9HC16 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC3GQ9HC16 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms