Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KNOP1Q1ED39 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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