Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH1Q15438 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms