Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SKP2Q13309 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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SKP2Q13309 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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SKP2Q13309 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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SKP2Q13309 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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SKP2Q13309 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SKP2Q13309 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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