Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBQ06643 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBQ06643 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBQ06643 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBQ06643 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBQ06643 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBQ06643 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBQ06643 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBQ06643 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBQ06643 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBQ06643 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBQ06643 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBQ06643 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBQ06643 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBQ06643 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBQ06643 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBQ06643 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBQ06643 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBQ06643 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBQ06643 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBQ06643 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBQ06643 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBQ06643 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBQ06643 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBQ06643 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBQ06643 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms